北京农学院生物信息学中心专注都市型特色农业相关的重要种质资源的功能基因组学与分子辅助育种的研究工作。建立动植物功能基因组及分子辅助育种分析平台，挖掘主要经济性状相关的重要调控基因，以及对其分子调控机理进行解析。同时在教育教学及公共服务方面提供支撑。

目前生物信息学中心共有4名核心成员，依据合作项目的实际开展情况，辐射生资学院、植科学院、园林学院、动科学院师资为中心合作成员，主要负责与中心合作项目的实施。承担并参与多个科研项目，开设或组织生物信息学相关的本科生和研究生课程，并积极开展国内外的学术交流。